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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3 directory
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/Makefile.cmake file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/configure file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/configure.ac file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/INSTALL_NOTES file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/LICENSE file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/Makefile.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/README file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/cust_general.m4 file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/FindBLAS.cmake file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/install-sh file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/ltmain.sh file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/mkinstalldirs file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/mod_c.m4 file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/mod_fortran.m4 file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/rminstalldirs file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/SundialsFortran.cmake file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/SundialsFortran.cmake.c99 file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/SundialsLapack.cmake file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/SundialsMPIC.cmake file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/config/SundialsMPIF.cmake file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/doc directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/doc/cvode directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/doc/cvode/cv_examples.pdf file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/doc/cvode/cv_guide.pdf file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/CMakeLists.txt file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_kry_bbd_p.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_kry_bbd_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_kry_p.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_kry_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_non_p.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/fcvDiag_non_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/Makefile.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_parallel/README file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/CMakeLists.txt file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvAdvDiff_bnd.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvAdvDiff_bnd.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvDiurnal_kry.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvDiurnal_kry.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvDiurnal_kry_bp.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvDiurnal_kry_bp.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvRoberts_dns.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvRoberts_dns.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvRoberts_dnsL.f file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/fcvRoberts_dnsL.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/Makefile.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/fcmix_serial/README file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/CMakeLists.txt file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvAdvDiff_non_p.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvAdvDiff_non_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvDiurnal_kry_bbd_p.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvDiurnal_kry_bbd_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvDiurnal_kry_p.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/cvDiurnal_kry_p.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/Makefile.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/parallel/README file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/CMakeLists.txt file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvAdvDiff_bndL.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvAdvDiff_bndL.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDirectDemo_ls.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDirectDemo_ls.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDiurnal_kry.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDiurnal_kry.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDiurnal_kry_bp.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvDiurnal_kry_bp.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvKrylovDemo_ls.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvKrylovDemo_ls.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvKrylovDemo_prec.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvKrylovDemo_prec.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dns.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dns.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dns_uw.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dns_uw.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dnsL.c file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/cvRoberts_dnsL.out file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/Makefile.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/cvode/serial/README file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/cmakelists_parallel_C_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/cmakelists_parallel_F77_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/cmakelists_serial_C_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/cmakelists_serial_F77_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/makefile_parallel_C_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/makefile_parallel_F77_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/makefile_serial_C_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/examples/templates/makefile_serial_F77_ex.in file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_band.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_bandpre.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_bbdpre.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_dense.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_diag.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_direct.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_lapack.h file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/cvode-2.6.0/include/cvode/cvode_spbcgs.h file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/network.cpp file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/run_network.cpp file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/function.cpp file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/species.hh file
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bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/rateExpressions/rateMuParser.hh file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/rateExpressions/rateSaturation.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions directory
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/bioNetGenRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/bioNetGenRxn.hh file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/elementaryRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/functionalRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/hillRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/michaelisMentenRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/model/reactions/saturationRxn.cpp file
bionetgen/bionetgen-2.9.0/bionetgen-BioNetGen-2.9.0/bng2/Network3/src/pla directory
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